Taller de herramientas para el análisis de secuencias
El Taller de Herramientas para Análisis de Secuencias (THAS) busca
entrenar a estudiantes y profesionales en el empleo de algunas
herramientas para análisis de secuencias, tanto de ácidos nucléicos como
de proteínas. El Taller nace como una necesidad para el Centro Nacional
de Calculo Científico de la ULA (CeCalCULA) de difundir el uso de
herramientas informáticas dirigidas a las ciencias biológicas y medicas.
El Taller se ha dictado en la Universidad de Los Andes desde 1997, año
en que se creó el centro, ajustándose constantemente a los cambios que
han sufridos las ciencias computaciones en la ultima década. El THAS se
ha dictado fuera de la ULA en aquellas instituciones, nacionales (UNET,
IDEA, UCV) e internacionales (Panamá y Costa Rica), que lo han
solicitado, teniendo muy buena acogida.
El objetivo de los Talleres es el aprendizaje-enseñanza de paquetes
completos (de distribución gratuita principalmente) para el tratamiento,
organización, distribución, visualización e interpretación de
información proveniente del estudio del genoma.
Es de carácter nacional y tendrá lugar del 14 al 18 de julio de 2008
en la Universidad de Los Andes con el apoyo total del Servidor de
Bioinformática del Centro Nacional de Cálculo Científico, CeCalCULA.
La Cátedra Simón Bolívar (Fundación Venezolana de Promoción al
Investigador) es un programa participativo y
alternativo que distingue a científicos o tecnólogos destacados en sus
respectivas áreas de competencia. Es por ello de vital importancia
reconocer el apoyo que proporciona para la realización de este taller.
Los participantes podrán traer sus propias secuencias para ser
analizadas con los diversos programas que se darán en el taller.
Audiencia:
Estudiante y profesionales de las Ciencias de la Salud y Biotecnología.
Patrocinantes:
Centro de Cálculo Científico CeCalCULA
Tópicos:
El programa está enfocado en los siguientes tópicos:
Manejo de EMBOSS
Búsqueda en Servidores Remotos (NCBI, EMBL, DDBJ, otros)
Bases de Datos ( de ácidos nucleicos, proteínas, estructuras 3D, genomas, otros)
Análisis de Secuencias (PM, % aa/nt, ubicación subcelular, restricción, 3D, otros)
Alineamiento Simple y Múltiple de Secuencias
Construcción de Árboles filogenéticos con Phylip y MEGA2
CLUSTAL, PHYLIP, Visualizadores 3D, otros.
Expositores:
Ascanio Rojas
David Rosales
Comité Organizador:
Dr. Luis Núnez
Centro de Cálculo Científico CeCalCULA
Mérida
Dra. Luisana Avilán
Laboratorio de Fisiología Animal
Mérida
Lic. José David Rosales
Unidad de Biotecnología
Mérida
Ascanio Rojas
CECALCULA
Mérida
Lugar y Fecha:
Fecha de Realización:
14 de julio de 2008
al 18 de julio de 2008
Horario:
Programa THAS 2008
Lunes
8:45-09:00
Introducción al curso
09;00-12:00
Conceptos Básicos: Biología celular y Genética.
14:15-16:15
Análisis de secuencias: Formatos de secuencias y manipulación secuencias.
16:45 - 18:00
Análisis de secuencias: Manipulación secuencias, edición.
Martes
08:15-10:15
Bases de Datos y servidores remotos
10:45-12:00
NCBI, EBI, GENOMES, etc
14:15-16:15
Búsqueda y adquisición de data
16:45 - 18:00
Búsquedas de Secuencias de nucleótidos y Proteínas, Bibliografía.
Miércoles
08:15-10:15
Búsqueda de símilaridad, Homología, Motivos, Familias de Proteínas
10:45-12:00
Conceptos de Alineamiento y BLAST
14:15-16:15
Alineamientos de proteínas y nucleótidos
16:45 – 18:00
CLUSTALW, MUSCLE, R-Coffee,
Jueves
08:15-10:15
Alineamientos múltiples, Secuencias consenso y motivos.
10:45-12:00
Diseño de Oligos y Clonaje
14:15-16:15
Predicción de genes
16:45 - 18:00
Predicción de estructura secundaria de proteínas,
Viernes
08:15-10:15
Introducción al uso de secuencias en genética de poblaciones, Epidemiología y Filogenia
10:45-12:00
Introducción al uso de secuencias en genética de poblaciones, Epidemiología y Filogenia
14:15-16:15
Marcadores, SNPs, Microarrays
16:45 - 18:00
Discusión y consideraciones generales.
Dirección:
El taller será dictado en el Laboratorio de Teleinformación (LABTEL) , Facultad de Ingeniería antes Facultad de Ciencias Sociales y Económicas, nivel patio, ala sur oeste. La Hechicera.
Información e Inscripciones:
http://www.cecalc.ula.ve/bioinformatica/thas/inscripcion.htm
Costo:
Estudiantes (con constancia de estudio emitida para la fecha) de 380 Bs F y para profesionales de 500 BsF.
Información de Contacto:
Jose David Rosales
E-mail: joser@cecalc.ula.ve,jdrr55@yahoo.com
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